Могу ли я открыть fastq-файлы текстовым редактором и прочитать их или напечатать? Какими программами я могу открыть эти файлы и что это мне даст?
30 октября 2019 г
5 минут
Файлы fastq не содержат в себе аннотированных вариантов последовательности ДНК; для получения списка вариантов они должны пройти еще несколько стадий биоинформатической обработки.
Каждая лаборатория имеет свой пайплайн (набор программ и скриптов для обработки данных секвенирования), который является интеллектуальной собственностью компании и не подлежит разглашению. Единой пользовательской программы для просмотра и анализа данных в формате fastq не существует. Мы не рекомендуем открывать fastq-файлы с помощью текстовых редакторов или печатать их ввиду нецелесообразности и большого размера файлов.