NGS при бесплодии
22 февраля 2023 г
5 минут
О применении секвенирования нового поколения (NGS) с целью проведения преконцепционного скрининга мы рассказывали в одной из публикаций ранее. Однако в репродуктивной генетике экзомное секвенирование также может быть ценным в поиске моногенных причин бесплодия.
Бесплодие является распространенной проблемой среди лиц репродуктивного возраста. Так, генетические факторы (хромосомные или моногенные нарушения) являются причиной 10-20% случаев мужского и 5-10% женского бесплодия (Toth B. et al., 2019). У 20-30% бесплодных пар мужское бесплодие сочетается с женским (Agarwal A., 2015). Таким образом, проблема может быть следствием совокупности патологий, наблюдающихся у обоих партнеров.
Генетические исследования при бесплодии, как правило, сводятся к анализу кариотипа, делеций локуса AZF (для мужчин), частых мутаций CFTR, премутации в гене FMR1 (для женщин), а также к анализу генов хорошо известных моногенных синдромов при наличии соответствующего фенотипа. Более редкие и несиндромальные формы бесплодия могут являться объектом исследования методом NGS.
В арсенале нашей Лаборатории недавно появилось два новых исследования моногенных причин бесплодия на основе полноэкзомного секвенирования – INFERTI и INFERTI +, которые могут выполняться как для одного партнера, так и для пары. Интерпретация NGS-данных проводится нашей опытной командой биоинформатиков с учетом клинической картины, значимости обнаруженных генетических вариантов и морбидности генов.
В основе исследований INFERTI лежит полноэкзомное секвенирование с дополнительным анализом премутации в гене FMR1 (синдром ломкой Х-хромосомы у женщин), связываемой с преждевременным истощением яичников. Отличие INFERTI+ от INFERTI состоит в том, что одновременно с поиском причин бесплодия INFERTI+ позволяет проанализировать носительство рецессивных заболеваний в паре при планировании беременности (СМА, муковисцидоз – вариант dele 2,3 в гене CFTR и др.), то есть включает преконцепционный скрининг.
Елизавета Мусатова, медицинский директор Genetico:
«Наши новые исследования призваны помочь пациентам с подозрением на генетическую причину бесплодия, когда привычные диагностические инструменты не дали результат. Важно, что в основе INFERTI лежит полноэкзомное секвенирование, а не панель генов. Это значит, что наш поиск возможных моногенных причин бесплодия не ограничен неким перечнем исследуемых генов. А в такой сравнительно новой и активно развивающейся области генетики, как генетика бесплодия, ограничение себя каким-либо списком генов может быть неэффективно, ведь уже завтра, к примеру, такой список может стать неактуальным в силу накопления новых знаний».
Почему носительство целесообразно анализировать при подготовке к беременности?
Так, по данным одного из исследований 6447 последовательностей экзома здоровых, генетически неродственных европейцев из Голландии и Эстонии Fridman et al., более 85% людей являются носителями по крайней мере одного патогенного или вероятного патогенного варианта. (Fridman H. et al., 2021).
По оценочным данным нашей Лаборатории, у каждого человека выявляется носительство в среднем трех патогенных или вероятно патогенных вариантов на скрининге.
На уровне пары информация по итогам проведенного экзомного секвенирования может быть использована для выявления потенциального риска передачи рецессивных генетических заболеваний потомству, что позволяет своевременно принимать обоснованные решения о выборе репродуктивной стратегии.
