Оценка уровня метилирования

Для исследования паттернов метилирования ДНК у различных организмов применятся подход с использованием бисульфитной конверсии. Данные метод основан на химической модификаци неметилированного цитозина в урацил бисульфитом натрия, в процессе секвенирования данное основание читается как тимидин. При этом метилированные цитизины остаются устойчивыми к бисульфиту и в процессе секвенирования прочитываются как цитозины. В лаборатории генетико возможна подготовка библиотек с предварительной обработкой ДНК бисульфитом и секвенированием на приборах платформы Illumina.

Оставить заявку

Почему стоит выбрать нас?

Индивидуальный подход к каждому исследованию

Мы выполняем поставленные задачи, учитывая особенности вашего исследования.Предоставляем полный отчет о проведенной работе.

Лучшие сроки выполнения исследования

Наша лаборатория и специалисты находятся в Москве, и не зависит от международных логистических цепочек.

Уникальный опыт исследовании в области генетики — более 10 лет на рынке

Используем только высокотехнологичное оборудование и оригинальные реагенты.

Высокий уровень безопасности полученных данных.

Все ваши данные исследований хранятся на защищённых серверах в России и не передаются в сторонние организации.

Технические характеристики исследования

Периферическая кровь должна быть взята в 2 пробирки с фиолетовой крышкой (которые содержат консервант ЭДТА), минимальный объем крови – 2 мл, лучше 4 мл. Пробирки с кровью могут храниться при температуре +2..+8*С до 5 суток. При более длительном хранении пробирки могут быть заморожены, но данный момент необходимо обговорить с лабораторией.

Парафиновые блоки могут быть отправлены как в виде блока, так и в виде парафиновой стружки в пробирке. Предпочтительнее — в виде стружки. Биоматериал может храниться при комнатной температуре.

1. Концентрация ДНК должна быть не менее 10 нг/мкл в 60 мкл (т.е. не менее 600 нг)

2. ДНК должна быть полностью растворена в буфере для элюции или воде)

3. Раствор ДНК должен быть чистым, т.е. не должен содержать хлопьев, осадков и прочего. Поскольку это может ингибировать дальнейшие реакции)

4. ДНК не должна быть деградирована по результатам электрофореза

1. Концентрация ДНК должна быть не менее 5 нг/мкл в 30 мкл (т.е. не менее 150 нг)

2. ДНК должна быть полностью растворена в буфере для элюции или воде)

4. ДНК не должна быть деградирована по результатам электрофореза

1. мРНК должна иметь поли-А хвост)

2. Концентрация total RNA должна быть не менее 6-10 нг/мкл в 50 мкл (т.е. не менее 300-500 нг)

3. РНК должна быть растворена в буфере для элюции или воде (свободных от РНКаз)

4. Раствор РНК должен быть чистым, т.е. не должен содержать хлопьев, осадков и прочего. Поскольку это может ингибировать дальнейшие реакции)

5. Транспортировка РНК должна проводится в жидком азоте или в сухом льду!

1. Тип библиотек, их длина (пар оснований), качество и используемые индексы должны быть заранее обговорены с Исполнителем)

2. Концентрация предоставляемых Заказчиком библиотек должна быть не менее 2,5 nM (Наномоль) при запуске 2х100, не менее 4 nM при запуске 2х150. Для подсчета используйте следующую формулу: Концентрация (nM) = (концентрация (нг/мкл)/длина библиотек (п.о.))*1515,15)

3. Объем библиотек (мкл), отправляемый на секвенирование, должен быть обговорен с Исполнителем)

4. Библиотеки должны быть растворены в буфере для элюции или воде

5. Раствор библиотек должен быть чистым, т.е. не должен содержать осадков и прочего

6. Условия транспортировки библиотек должны быть обговорены с Исполнителем