Секвенирование экзома, генома и транскриптома

Секвенирование экзома:
Подготовка библиотек ДНК включает в себя фрагментацию ДНК до 150-180 пар оснований, удаление выступающих липких концов, аденилирование, присоединение специальных адаптерных последовательностей (включающих баркоды, позволяющие отличить образцы после проведения секвенирования), наработку фрагментов с присоединенными адаптерами и гибридизацию с ДНК-пробами, которые дают возможность отделить только белок-кодирующую область генома человека (экзом). Секвенирование экзома проводится на приборе NovaSeq 6000 Illumina.

Секвенирование генома:
Пробоподготовка для секвенирования генома человека и других организмов включает в себя фрагментацию ДНК до 340-360 пар оснований, удаление выступающих липких концов, аденилирование, присоединение специальных адаптерных последовательностей (включающих баркоды, позволяющие отличить образцы после проведения секвенирования) и ПЦР-амплификация. По согласованию возможна подготовка PCR-free библиотек (без ПЦР). Секвенирование генома проводится на приборе NovaSeq 6000 Illumina.

Секвенирование транскриптома:
Лаборатория Genetico оказывает услуги по подготовке транскриптомных библиотек и их последующему секвенированию. Пробоподготовка состоит из «захвата» молекул мРНК, содержащих полиА хвосты. Очищенные мРНК фрагментируются и синтезируются в комплементарную ДНК первой цепи (кДНК) с помощью обратной транскриптазы. На этапе синтеза второй цепи происходит модификация кДНК, которая позволяет определить, с какой цепи – прямой или обратной – прочитался фрагмент в процессе секвенирования. Затем к полученной кДНК присоединяются специальные адаптерные последовательности (включающие баркоды, позволяющие отличить образцы после проведения секвенирования), полученные продукты очищают и селективно амплифицируют для секвенирования.

Оставить заявку

Почему стоит выбрать нас?

Индивидуальный подход к каждому исследованию

Мы выполняем поставленные задачи, учитывая особенности вашего исследования.Предоставляем полный отчет о проведенной работе.

Лучшие сроки выполнения исследования

Наша лаборатория и специалисты находятся в Москве, и не зависит от международных логистических цепочек.

Уникальный опыт исследовании в области генетики — более 10 лет на рынке

Используем только высокотехнологичное оборудование и оригинальные реагенты.

Высокий уровень безопасности полученных данных.

Все ваши данные исследований хранятся на защищённых серверах в России и не передаются в сторонние организации.

Технические характеристики исследования

Периферическая кровь должна быть взята в 2 пробирки с фиолетовой крышкой (которые содержат консервант ЭДТА), минимальный объем крови – 2 мл, лучше 4 мл. Пробирки с кровью могут храниться при температуре +2..+8*С до 5 суток. При более длительном хранении пробирки могут быть заморожены, но данный момент необходимо обговорить с лабораторией.

Парафиновые блоки могут быть отправлены как в виде блока, так и в виде парафиновой стружки в пробирке. Предпочтительнее — в виде стружки. Биоматериал может храниться при комнатной температуре.

1. Концентрация ДНК должна быть не менее 10 нг/мкл в 60 мкл (т.е. не менее 600 нг)

2. ДНК должна быть полностью растворена в буфере для элюции или воде)

3. Раствор ДНК должен быть чистым, т.е. не должен содержать хлопьев, осадков и прочего. Поскольку это может ингибировать дальнейшие реакции)

4. ДНК не должна быть деградирована по результатам электрофореза

1. Концентрация ДНК должна быть не менее 5 нг/мкл в 30 мкл (т.е. не менее 150 нг)

2. ДНК должна быть полностью растворена в буфере для элюции или воде)

4. ДНК не должна быть деградирована по результатам электрофореза

1. мРНК должна иметь поли-А хвост)

2. Концентрация total RNA должна быть не менее 6-10 нг/мкл в 50 мкл (т.е. не менее 300-500 нг)

3. РНК должна быть растворена в буфере для элюции или воде (свободных от РНКаз)

4. Раствор РНК должен быть чистым, т.е. не должен содержать хлопьев, осадков и прочего. Поскольку это может ингибировать дальнейшие реакции)

5. Транспортировка РНК должна проводится в жидком азоте или в сухом льду!

Оборудование которое
мы используем

Nextseq 550

Miseq

3500 Applied Biosystems

NovaSeq 6000

Контакты

Екатерина Камалова

Руководитель отдела развития геномного секвенирования

info@genetico.ru

+7 (499) 955-47-62

Секвенирование экзома, генома и транскриптома

Почему стоит выбрать нас?

Технические характеристики исследования

Оборудование которое мы используем

Контакты

Оборудование которое
мы используем