эндометрия
Нестандартные образцы для ДНК-теста
Содержание:
Выделение ДНК
Начальным этапом, который оказывает существенное влияние на результаты различных молекулярно-генетических исследований, является процедура выделения и последующей очистки ДНК из различных биологических образцов. Для выделения ДНК из различных биологических объектов существует широкий спектр методов выделения. Основная цель этапа, связанного с выделением и очисткой ДНК, является получение отчищенного препарата ДНК, который может быть использован для различных молекулярно-генетических манипуляций, таких как амплификация, обнаружение продуктов амплификации методом полимеразной цепной реакции, клонирование, секвенирование ДНК, гибридизация и т.д. [1,3].
Сбор и хранение биологических образцов
Важным аспектом сбора биологического материала является подписание добровольного согласия пациента, которое позволяет получить его материал, хранить в течение определенного промежутка времени и использовать данные образцы в научных и медицинских целях. Процесс сбора биологических образцов для медицинского анализа (кровь, биоптаты) можно производить в специализированных медицинских организациях или на дому (сбор образцов мочи или фекалий). Далее биологические образцы поступают в биобанк на хранение или в научно-исследовательскую лабораторию с целью непосредственного выделения ДНК. В зависимости от типа биологического препарата, длительности хранения и целей анализа, образцы могут храниться при различной температуре (-20°C, -80°C, -196°C)[2].
Источники ДНК и нестандартные образцы для ДНК-теста
Источниками геномной ДНК являются препараты ткани (FFPE (парафиновые блоки фиксированных формалином тканей) и свежезамороженные препараты тканей) и кровь (цельная кровь, сухие пятна крови, лейкоцитарная пленка, мононуклеарные клетки крови).
Также широко используются образцы, взятые из спинномозговой жидкости, мочи и фекалий. Источниками внеклеточной ДНК обычно являются кровь (сыворотка и плазма), моча, слюна, синовиальная и цереброспинальная жидкости. Источниками ДНК микробиоты кишечника являются фекалии[2]. Кроме того ДНК выделяют из таких биологических образцов, как буккальный эпителий, волосяные луковицы, материал зубов, мышечная ткань, ногти, мумифицированная ткань, сперма, ушная сера, скелетная мышца, абортированный материал, пуповина, и таких предметоносителей, на которых остаются единичные клетки, как сигаретные окурки, жевательная резинка, столовые приборы, салфетка и платки, смывы с предметов обихода (ручки, мобильный телефон, очки, часы, ювелирные украшения и т.д.), детская соска, фрагменты одежды/ткани, зубная щетка, лезвие бритвы.
Нестандартными образцами для ДНК-теста являются предметоносители с низкой вероятность получения высокого выхода из биологических образцов. К ним относятся медицинская маска, зубочистка, презерватив, прокладка/тампон, подгузник, детская игрушка, трубочки, фрагменты обшивки автомобиля/смывы с руля, регуляторов сидений и переключателей света, стакан с отпечатками пальцев, бокал, расческа, горлышко от бутылки, беруши.
Список используемой литературы:
- Лубенникова М.В., Афанасьев В.А., Афанасьев К.А. (2020). Выделение ДНК — важный этап молекулярно-генетического исследования. Электронный научно-методический журнал Омского ГАУ, (2 (21)), 4.
- Долудин Ю. В., Лимонова А. С., Козлова В. А., Ефимова И. А., Борисова А. Л., Мешков А. Н., Покровская М. С., Драпкина О. М. (2020). Сбор и хранение ДНК-содержащего биоматериала и выделенной ДНК. Кардиоваскулярная терапия и профилактика, 19 (6), 196-204.
- Аукенов Н.Е., Масабаева М.Р., Хасанова У.У. (2014). Выделение и очистка нуклеиновых кислот. Состояние проблемы на современном этапе. Наука и здравоохранение, (1), 51-53.