В норме весь генетический материал человека распределен в 46 хромосомах (23 парах).
Нарушения числа хромосом возникают достаточно часто, и будущий эмбрион может получить лишнюю хромосому или может произойти потеря какой-либо хромосомы.
Ранее, при проведении ПГТ-А анализировали 5 хромосом (13, 18, 21, X и Y), нарушения в которых вызывают развитие наиболее частых наследственных заболеваний, вызванных хромосомными нарушениями у будущего ребенка. В то же время нарушения в остальных хромосомах могут стать причиной переноса нежизнеспособного эмбриона, самопроизвольного прерывания беременности и др.
Для того чтобы увеличить результативность ЭКО, необходимо проводить ПГТ всех 46 хромосом.
В лаборатории Genetico анализ хромосомных аномалий в эмбрионах проводится по 46 хромосомам – полному хромосомному набору одной клетки. Genetico использует метод NGS (next generation sequencing – высокопроизводительное секвенирование), который основан на определении последовательности ДНК.
В основе метода лежит секвенирование нового поколения, в процессе которого осуществляется высокопроизводительное прочтение участков ДНК всех 46 хромосом, а после программной обработки полученных данных делается вывод о количественных изменениях хромосомного материала.
Для того чтобы увеличить результативность ЭКО, необходимо проводить ПГТ всех 46 хромосом.
ПГТ-А позволяет детектировать: анеуплоидии, мозаицизм более 20%, делеции/дупликации в пределах разрешающей способности метода.
Как проводится преимплантационное генетическое тестирование
Основные этапы:
• 1 этап. Биопсия: на 5-6 сутки жизни эмбриона, полученного в рамках протокола ЭКО, эмбриолог берет несколько клеток для генетического исследования. В это время клетки эмбриона уже подразделяются на внутреннюю клеточную массу (эмбриобласт), из которой в дальнейшем развивается тело эмбриона, и внешнюю (трофэктодерму) — будущую плаценту. Несколько клеток трофэктодермы и будут образцом ДНК для ПГТ-А.
• 2 этап. Транспортировка: материал биопсии помещается в пробирку и при строгих температурных условиях доставляется в лабораторию Genetico. Сам эмбрион остается в клинике и, как правило, криоконсервируется.
• 3 этап. Проведение самого ПГТ-А: в лаборатории ДНК, полученная из нескольких клеток, многократно множится (этап амплификации), а затем выполняется ПГТ тем или иным методом.
• 4 этап. Проверка заключения тремя независимыми специалистами лаборатории Genetico.
• 5 этап. Выдача заключения: по результатам ПГТ-А выдается заключение, какой из эмбрионов рекомендован к переносу.
Какие виды ПГТ-А выполняют в Genetico?
• Эмбриотест начального разрешения — секвенирование с количеством прочтений
250 тысяч ридов;
• Эмбриотест базового разрешения — секвенирование с количеством прочтений
500 тысяч ридов;
• Эмбриотест высокого разрешения — секвенирование с количеством прочтений
1 миллион ридов.
В чем отличия, высокого разрешения, базового разрешения, начального разрешения
ПГТ на хромосомные аномалии позволяет отбирать эмбрионы без хромосомных нарушений, в пределах разрешающей способности метода.
Чем больше количество прочтений (ридов) на образец, тем выше плотность покрытия каждой хромосомы этими прочтениями. Таким образом, остается меньше количество участков, о которых мы ничего не знаем.
Хромосомные аномалии
Анеуплоидия — изменение набора хромосом, при котором их число в клетках не соответствует норме.
Для человека норма это 46 хромосом: 22 пары аутосом (они одинаковые для обоих полов) и 23-я пара это половые хромосомы (они определяют пол будущего ребенка).
Нормальная хромосомная формула может записываться, 46,ХХ — для женщин и 46,ХУ — для мужчин.
Различают аутосомную анеуплоидию и анеуплоидию половых хромосом.
Среди живорожденных, чаще всего, встречаются трисомии (то есть ситуации, когда вместо двух хромосом одной пары — три) по 21 (синдром Дауна), 18 (синдром Эдвардса) и 13 (синдром Патау) хромосомам. Трисомии 18 и 13 сопровождаются наличием тяжелых множественных пороков развития, из-за которых дети погибают в первые годы или даже месяцы жизни. Дети с трисомией 21 всегда имеют пороки развития и их тяжесть не столь велика.
Анеуплоидии возможны и по другим парам хромосом и их возникновение приводит к самопроизвольному прерыванию беременности на ранних сроках.
Сегментарные нарушения — делеции и дупликации, то есть частичная потеря или увеличение количества хромосомного материала той или иной хромосомы, соответственно. При этом количество хромосом остается нормальным, 46.
Клинические проявления дупликационных/делеционных синдромов часто схожи и включают в себя задержку психомоторного и речевого развития, различные фенотипические особенности, аномалии развития внутренних органов в той или иной степени выраженности (причем даже внутри одного синдрома степень выраженности симптомов у разных пациентов может быть разная).
Если эмбрион с сегментарным нарушением будет перенесен, то в зависимости от размера, характера (делеция это или дупликация), того, на какой хромосоме произошла перестройка и какие именно гены вовлечены в эту перестройку, это может привести к гибели эмбриона до имплантации или на ранних сроках беременности, формированию пороков развития плода или рождению плода с нарушением развития.
ПГТ-А Эмбриотест
Генетический скрининг хромосомных аномалий, с целью повышения эффективности лечения бесплодия в протоколе ЭКО.
Большинство хромосомных аномалии не позволяют беременности достигнуть ее логического завершения — родов. Одним из вариантов геномных изменений, которые приводят к гибели зародыша еще на самых ранних этапах его развития, является полиплоидия.
Последствия возникновения изменений генетического материала могут быть разными: часть генетических вариантов, например, защищает человека от инфекционных заболеваний, другие же способны вызывать серьезные патологии развития.
Одним из таких изменений являются дупликации.
Важным направлением работы Genetico является репродуктивная генетика: диагностика генетически обусловленного бесплодия и повышение эффективности вспомогательных репродуктивных технологий (ЭКО).
